Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAPBPO15533 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAPBPO15533 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAPBPO15533 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAPBPO15533 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms