Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSC2O15499 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GSC2O15499 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSC2O15499 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSC2O15499 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSC2O15499 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSC2O15499 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSC2O15499 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSC2O15499 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSC2O15499 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSC2O15499 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSC2O15499 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSC2O15499 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSC2O15499 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSC2O15499 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSC2O15499 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GSC2O15499 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSC2O15499 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSC2O15499 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSC2O15499 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSC2O15499 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSC2O15499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSC2O15499 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSC2O15499 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GSC2O15499 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSC2O15499 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSC2O15499 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSC2O15499 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSC2O15499 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GSC2O15499 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSC2O15499 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSC2O15499 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSC2O15499 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSC2O15499 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSC2O15499 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSC2O15499 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSC2O15499 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSC2O15499 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSC2O15499 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSC2O15499 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSC2O15499 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSC2O15499 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSC2O15499 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSC2O15499 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSC2O15499 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSC2O15499 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSC2O15499 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSC2O15499 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSC2O15499 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSC2O15499 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSC2O15499 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSC2O15499 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSC2O15499 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSC2O15499 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSC2O15499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSC2O15499 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSC2O15499 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSC2O15499 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GSC2O15499 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSC2O15499 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSC2O15499 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSC2O15499 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSC2O15499 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSC2O15499 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSC2O15499 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSC2O15499 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSC2O15499 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSC2O15499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSC2O15499 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSC2O15499 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSC2O15499 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSC2O15499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GSC2O15499 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms