Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FANCAO15360 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FANCAO15360 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FANCAO15360 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FANCAO15360 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
FANCAO15360 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FANCAO15360 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
FANCAO15360 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FANCAO15360 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
FANCAO15360 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FANCAO15360 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FANCAO15360 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FANCAO15360 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FANCAO15360 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FANCAO15360 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCAO15360 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FANCAO15360 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
FANCAO15360 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FANCAO15360 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FANCAO15360 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FANCAO15360 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
FANCAO15360 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FANCAO15360 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCAO15360 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCAO15360 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCAO15360 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCAO15360 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCAO15360 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCAO15360 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FANCAO15360 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FANCAO15360 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
FANCAO15360 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
FANCAO15360 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FANCAO15360 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FANCAO15360 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FANCAO15360 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FANCAO15360 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FANCAO15360 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FANCAO15360 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FANCAO15360 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FANCAO15360 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FANCAO15360 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FANCAO15360 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FANCAO15360 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FANCAO15360 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FANCAO15360 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FANCAO15360 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FANCAO15360 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FANCAO15360 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FANCAO15360 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
FANCAO15360 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FANCAO15360 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FANCAO15360 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FANCAO15360 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
FANCAO15360 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
FANCAO15360 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FANCAO15360 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FANCAO15360 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FANCAO15360 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FANCAO15360 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FANCAO15360 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FANCAO15360 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FANCAO15360 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
FANCAO15360 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
FANCAO15360 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FANCAO15360 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FANCAO15360 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FANCAO15360 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FANCAO15360 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FANCAO15360 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCAO15360 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCAO15360 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCAO15360 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FANCAO15360 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
FANCAO15360 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
FANCAO15360 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FANCAO15360 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FANCAO15360 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FANCAO15360 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms