Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNPHO15079 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNPHO15079 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNPHO15079 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNPHO15079 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNPHO15079 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNPHO15079 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNPHO15079 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNPHO15079 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNPHO15079 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNPHO15079 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNPHO15079 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNPHO15079 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNPHO15079 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNPHO15079 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNPHO15079 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNPHO15079 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNPHO15079 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNPHO15079 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNPHO15079 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNPHO15079 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNPHO15079 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNPHO15079 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNPHO15079 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNPHO15079 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNPHO15079 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNPHO15079 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNPHO15079 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNPHO15079 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNPHO15079 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNPHO15079 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNPHO15079 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNPHO15079 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNPHO15079 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNPHO15079 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNPHO15079 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNPHO15079 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNPHO15079 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNPHO15079 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNPHO15079 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNPHO15079 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNPHO15079 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNPHO15079 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNPHO15079 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNPHO15079 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNPHO15079 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNPHO15079 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNPHO15079 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNPHO15079 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNPHO15079 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms