Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR3AO14802 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR3AO14802 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR3AO14802 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR3AO14802 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLR3AO14802 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLR3AO14802 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms