Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHD1O14646 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHD1O14646 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHD1O14646 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CHD1O14646 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CHD1O14646 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHD1O14646 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHD1O14646 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHD1O14646 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CHD1O14646 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHD1O14646 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHD1O14646 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHD1O14646 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHD1O14646 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHD1O14646 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHD1O14646 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CHD1O14646 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CHD1O14646 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
CHD1O14646 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHD1O14646 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CHD1O14646 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CHD1O14646 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CHD1O14646 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHD1O14646 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHD1O14646 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CHD1O14646 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHD1O14646 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHD1O14646 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CHD1O14646 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHD1O14646 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CHD1O14646 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CHD1O14646 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CHD1O14646 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CHD1O14646 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CHD1O14646 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CHD1O14646 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CHD1O14646 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHD1O14646 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHD1O14646 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHD1O14646 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHD1O14646 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHD1O14646 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHD1O14646 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHD1O14646 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHD1O14646 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CHD1O14646 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CHD1O14646 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CHD1O14646 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
CHD1O14646 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CHD1O14646 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CHD1O14646 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CHD1O14646 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHD1O14646 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHD1O14646 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHD1O14646 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHD1O14646 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CHD1O14646 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CHD1O14646 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CHD1O14646 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CHD1O14646 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CHD1O14646 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHD1O14646 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHD1O14646 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CHD1O14646 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHD1O14646 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHD1O14646 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CHD1O14646 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHD1O14646 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHD1O14646 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CHD1O14646 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CHD1O14646 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CHD1O14646 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CHD1O14646 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CHD1O14646 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CHD1O14646 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CHD1O14646 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
CHD1O14646 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHD1O14646 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHD1O14646 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms