Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VCYO14598 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VCYO14598 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VCYO14598 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VCYO14598 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VCYO14598 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VCYO14598 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VCYO14598 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VCYO14598 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VCYO14598 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VCYO14598 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VCYO14598 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VCYO14598 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VCYO14598 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VCYO14598 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VCYO14598 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VCYO14598 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VCYO14598 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VCYO14598 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VCYO14598 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VCYO14598 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VCYO14598 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VCYO14598 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VCYO14598 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VCYO14598 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VCYO14598 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VCYO14598 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VCYO14598 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VCYO14598 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms