Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN4O14493 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN4O14493 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN4O14493 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN4O14493 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN4O14493 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN4O14493 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN4O14493 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN4O14493 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms