Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KPNA4O00629 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms