Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A1O00337 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC28A1O00337 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC28A1O00337 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms