Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF11BO00300 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF11BO00300 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms