Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4O00268 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4O00268 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF4O00268 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF4O00268 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4O00268 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4O00268 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4O00268 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4O00268 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4O00268 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF4O00268 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF4O00268 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4O00268 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4O00268 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4O00268 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4O00268 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF4O00268 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4O00268 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4O00268 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4O00268 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4O00268 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF4O00268 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4O00268 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4O00268 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4O00268 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4O00268 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4O00268 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF4O00268 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF4O00268 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4O00268 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4O00268 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4O00268 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4O00268 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF4O00268 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4O00268 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4O00268 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4O00268 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4O00268 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4O00268 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF4O00268 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4O00268 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4O00268 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4O00268 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4O00268 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF4O00268 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF4O00268 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF4O00268 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF4O00268 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF4O00268 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF4O00268 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF4O00268 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF4O00268 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF4O00268 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF4O00268 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF4O00268 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF4O00268 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF4O00268 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF4O00268 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms