Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC179H3BU77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC179H3BU77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC179H3BU77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms