Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8VVB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
F8VVB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8VVB4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8VVB4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8VVB4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8VVB4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
F8VVB4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
F8VVB4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
F8VVB4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
F8VVB4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
F8VVB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8VVB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8VVB4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
F8VVB4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8VVB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8VVB4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8VVB4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8VVB4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8VVB4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
F8VVB4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8VVB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
F8VVB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8VVB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8VVB4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
F8VVB4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8VVB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8VVB4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8VVB4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8VVB4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8VVB4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
F8VVB4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
F8VVB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8VVB4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8VVB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8VVB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8VVB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
F8VVB4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
F8VVB4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
F8VVB4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
F8VVB4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
F8VVB4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
F8VVB4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
F8VVB4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
F8VVB4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8VVB4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8VVB4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8VVB4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8VVB4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
F8VVB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8VVB4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8VVB4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8VVB4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8VVB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
F8VVB4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
F8VVB4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms