Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP99D6REC4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP99D6REC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP99D6REC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms