Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A8MVJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A8MVJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A8MVJ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A8MVJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MVJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A8MVJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A8MVJ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A8MVJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A8MVJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A8MVJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A8MVJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A8MVJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A8MVJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A8MVJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A8MVJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A8MVJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A8MVJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A8MVJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A8MVJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A8MVJ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A8MVJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms