Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01546A6NGU7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01546A6NGU7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01546A6NGU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms