Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM64A6NGJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM64A6NGJ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64A6NGJ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms