Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L3A6NCW0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L3A6NCW0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L3A6NCW0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms