Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRAMEF22A3QJZ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRAMEF22A3QJZ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRAMEF22A3QJZ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms