Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC144AA2RUR9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC144AA2RUR9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC144AA2RUR9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC144AA2RUR9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC144AA2RUR9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms