Protein–RNA interactions for Protein: A2A288

ZC3H12D, Probable ribonuclease ZC3H12D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12DA2A288 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H12DA2A288 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12DA2A288 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZC3H12DA2A288 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC3H12DA2A288 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms