Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPVL1A0A0U1RR11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPVL1A0A0U1RR11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPVL1A0A0U1RR11 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms