Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms