Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms