Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H8

IGKV1D-42, Immunoglobulin kappa variable 1D-42 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-42A0A075B6H8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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IGKV1D-42A0A075B6H8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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IGKV1D-42A0A075B6H8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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IGKV1D-42A0A075B6H8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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IGKV1D-42A0A075B6H8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-42A0A075B6H8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGKV1D-42A0A075B6H8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1D-42A0A075B6H8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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