Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC5Q9UQL6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC5Q9UQL6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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