Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM35Q9UPQ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms