Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXD3Q9UJU5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD3Q9UJU5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms