Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSPNQ9HAW4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms