Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms