Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBM4Q9BWF3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBM4Q9BWF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms