Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms