Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC2Q96PR1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNC2Q96PR1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms