Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YIPF6Q96EC8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms