Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DPF3Q92784 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DPF3Q92784 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DPF3Q92784 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms