Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COPS9Q8WXC6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms