Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SYT9Q86SS6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SYT9Q86SS6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYT9Q86SS6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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