Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FAM78BQ5VT40 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM78BQ5VT40 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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