Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPROQ16827 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPROQ16827 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPROQ16827 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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