Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RPE65Q16518 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RPE65Q16518 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPE65Q16518 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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