Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC3Q15034 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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