Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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BECN1Q14457 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BECN1Q14457 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BECN1Q14457 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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