Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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