Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CUL4AQ13619 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CUL4AQ13619 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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