Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SP140Q13342 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SP140Q13342 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SP140Q13342 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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