Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALCOCO2Q13137 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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