Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BNIP3Q12983 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms