Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPIBQ01892 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms