Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP2P53365 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms